بقعه سید امین الدین جبرائیل پدر شیخ صفی الدین اسحق اردبیلی جد سلاطین صفوی در روستای كلخوران قراردارد. روستای كلخوران به نام شیخ مشهور است و كلخوران شیخ نامیده میشود. بنای بقعه مربوط به اوایل قرن دهم هجری قمری است. این بنا در محوطه مشجری به ابعاد 200 در 150 متر قراردارد كه مقبره سید امین الدین جبرائیل به صورت یك هشت ضلعی در وسط باغ قرار گرفته است. قسمتی از نمای بنا در پاكار از سنگهای منظم بوده كه روی آنها دیوارهای جانبی بقعه از آجر ساخته شده است. در نمای بیرونی بقعه از تزئینات كاشی هم به صورت تلفیقی استفاده شده است. سقف این بقعه به صورت مسطح است كه در وسط آن گنبد آجری بالنسبه بزرگی به چشمی میخورد. در ورودی بقعه در زیر یك ایوان قرار گرفته كه دارای تذهیب كاشی است بیت زیر در بالای در ورودی نقش بسته است. هر كسی كو به ادب دست برین در ننهد بی شك از پای درآید به یقیین سر بنهد. در جناحین در ورودی نقش یك شیر و یك پلنگ نقاشی شده است كه با زنجیر بسته شده اند. سبك نقاشی مربوط به دوره صفوی است. داخل رواق بقعه دارای گچبری و مقرنس كاری بسیار ظریف و زیبایی است. در طرفین رواق دو خواجه نشین ساخته شده كه به اتاقهای كوچكی ختم میشود. از وجود اتاقها برای بیتوته زائران بقعه استفاده میشده است. سقف رواق دارای گچبریهایی است كه با رنگهای طلایی و آبی دارای اسلیمیهای زیبا و گلهای شاه عباسی است كه حاكی از آرامش و معنویت محیط و مكان بقعه است. دیوارهای جانبی رواق دارای كاشیكاری معرق و در بعضی از قسمتها از كاشیهای اصیل هشت ضلعی استفاده شده است. در ورودی بقعه از چوب جنگلی ساخته شده كه روی آن اشكالی به صورت لوزی و شش ضلعی نقش بسته است. آثار هنری از جمله كنده كاری و منبت روی این در مشاهده میشود. در حاشیه لنگه درها اشعاری به صورت برجسته كار شده است كه بعضی از مصراع آن ریخته و از بین رفته است0متن دیگری به خط ثلث روی در نقش بسته است. مضون زیر در لنگه راست در منقوش است :(( اجتمع الناس علی حب علی بن ابی طالب لما خلق الله النار)) وروی لنگه چپ جمله (( الهم یا مفتح ابواب افتح )) مشاهده میشود. آنچه از مضمون كلام منقوش روی درها حاصل میشود تعمیرات اصلی بقعه به تاریخ 1030 ه.ق انجام گرفته است. در یك كتیبه چنین آمده است:(( عمل كمترین بندگان شاه طاهر بن سلطان محمد نقاش 1031 كه ایشان یكی از اساتید مشهور دوره صفویه است)). در وسط رواق مقبره صندوق چوبی و ساده سید امین الدین جبرائیل قرار گرفته است كه ابعاد آن 5/1 در 2 در 3 متر است. بنابر اقوال جهانگردان این بقعه در دروه صفوی دارای فرشهای زیبا و پرده های نفیس بوده كه اكنون اثری از آنها باقی نیست. روی ازاره بیرونی دیوارهای جانبی بقعه آیاتی از كلام الله مجید به صورت گچبری نقش بسته كه از اهمیت هنری شایان توجهی برخوردار است. در طرفین شاه نشین جنوبی بقعه دو اتاق شش ضلعی قرار دارد كه دارای سقف مقرنس زیبا و ظریفی است كه كتیبه زیر بالای در چوبی آن نقش بسته است: (( تعمیر حرم مطهر و صحن مبارك به سعی فقیر مشهدی محمد آقا عتیقه چی تبریزی الاصل اردبیلی مسكن هیجدهم ذیحجه 1134 )).
