از آثار زمان شاهرخ و بانی ان غیاث الدین یوسف خواجه بهادر یكی از امرای خراسان است و در سال 1088 به دستور شاه سلیمان صفوی مرمت گردیده است . از لحاظ تزیینات و كاشی كاریها و نقاشیها بسیار قابل توجه است. این مدرسه دو گنبد در دو ضلع جنوبی دارد . در میان همین گنبد سنگ قبری با تاریخ 846 و نام یوسف خواجه بهادر موجود است .مورخ گرانمایه مهدی سیدی معتقد است كه مدرسه دودر و گورهای آن متعلق به خانواده امیر شیخ علی بهادر است.
