بنای امامزاده باقر بنایی آجری با طرح چهار ضلعی از خارج و هشت ضلعی از داخل است كه ضلعهای داخل، یك در میان بزرگ و كوچك هستند. بر روی بنا گنبد دایره ای شكل با آجر و گچ استوار شده است . بر روی سنگ قبر روی مرقد چنین خوانده میشود : وفات السید الفاضل بها الدین محمد بن باقر الحسینی رحمه الله 28 شهر جمادی الثانیه سنه 1132 ق برروی سنگ مزبور صندوق چوبی ساده ای قرار داده اند.
