مدرسه عباسقلی خان توسط حاکم هرات که به همین نام بوده ساخته شده و در کتیبه سر در آن نام او را آورده اند. این مدرسه دارای 4 ایوان و دو طبقه است که با 12 پله بهم وصل می شود. دور تا دور مدرسه 104 حجره برای طلاب وجود دارد. سردر حجره ها کاشی کاری و گچ کاری شده و برای ساخت کلی بنا از آجر استفاده کرده اند. مدرسه عباسقلی خان در خیابان نواب صفوی قرار داشته و از ساختمان های مربوط به حرم محسوب می شود.